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Logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur : le comparatif

Ce qu'un auto-entrepreneur doit vraiment tenir comme comptabilité, et les logiciels qui le font pour lui, gratuits ou payants (tarifs relevés en novembre 2026).

6logiciels comparés
09/11tarifs relevés le 9 novembre 2026

Nos choix sont indépendants. Si vous achetez via nos liens, nous touchons une commission, sans surcoût pour vous. Comment nous sommes financés

Notre sélection

tarifs relevés le 09/11/2026
  1. 01
    Indy

    Notre choix · La comptabilité automatisée qui démarre gratuitement et suit l'entreprise si elle change de statut.

    0 à 9 € HT/mois
  2. 02
    Abby

    Tout-en-un micro · Factures, livre des recettes, cotisations et seuils : la gestion complète de la micro-entreprise.

    0 à 9 € HT/mois
  3. 03
    Tiime

    Avec compte pro · Comptabilité, facturation et compte pro réunis, avec une formule pensée pour les auto-entrepreneurs.

    dès 9,99 € HT/mois
Le détail des 3 choix et des 3 autres logiciels

Aussi comparés

  • PennylaneCompta et compte pro réunis, très utilisé par les experts-comptablesdès 7 € HT/mois (avec compte pro)Voir l’offre
  • FreebeTableau de bord du freelance, livre des recettes inclus12,50 €/moisVoir l’offre
  • HenrriFacturation gratuite ; comptabilité à compléter0 à 9 € HT/moisVoir l’offre

À savoir avant de choisir

  • Un auto-entrepreneur n'a pas de comptabilité complète à tenir : il doit tenir un livre des recettes chronologique et, s'il vend des marchandises ou de l'hébergement, un registre des achats, et garder ses factures.
  • Un logiciel fait ce travail automatiquement à partir du compte bancaire et des factures émises, et prépare les déclarations à l'Urssaf.
  • Des formules gratuites existent (Indy Essentiel, Abby) ; les formules payantes démarrent autour de 9 à 10 € HT par mois (relevé du 09/11/2026).
  • Le jour où vous passez au réel ou en société, il faut une vraie comptabilité : choisissez un outil qui peut suivre ce changement.
Sommaire
  1. Notre sélection
  2. Le détail des choix
  3. Les obligations
  4. Choisir selon sa situation
  5. Les tarifs
  6. Les fonctions
  7. Le passage au réel
  8. Sources
  9. Questions fréquentes

Le détail des choix

01

Indy

Notre choixTarifs vérifiés

Capture de la page d'accueil du site Indy
indy.fr, 12/11/2026
Formules
Essentiel 0 €, Plus 9 €, Autonomie 22 € HT/mois (annuel)
Point fort
Catégorisation bancaire automatique
Pour qui
Auto-entrepreneur qui prévoit d'évoluer
Tarif relevé
0 à 9 € HT/mois

Indy relie le compte bancaire, catégorise les opérations et tient le livre des recettes. Il gère aussi les entreprises au réel et les sociétés, ce qui évite de changer d'outil le jour où le statut change.

Points forts

  • Formule gratuite
  • Suit le passage au réel ou en société

Points faibles

  • Plus complet que nécessaire pour une micro simple
  • Accompagnement humain dans les formules hautes
02

Abby

Tout-en-un microTarifs vérifiés

Formules
Gratuit, Start 9 €, Pro 15 €, Business 33 € HT/mois
Point fort
Pensé pour l'auto-entreprise
Pour qui
Auto-entrepreneur qui facture beaucoup
Tarif relevé
0 à 9 € HT/mois

Abby part de la facturation et y ajoute ce dont un auto-entrepreneur a besoin : livre des recettes, estimation des cotisations, alertes de seuils, et une comptabilité avancée dans la formule Business.

Points forts

  • Facturation et suivi réunis
  • Alertes de seuils de TVA

Points faibles

  • Comptabilité avancée réservée à la formule haute
  • Moins adapté en société
03

Tiime

Avec compte proTarifs vérifiés

Capture de la page d'accueil du site Tiime
tiime.fr, 12/11/2026
Formules
Initial 9,99 €, Smart 17,99 € HT/mois (annuel)
Point fort
Compte pro inclus selon formule
Pour qui
Qui veut un seul outil pour tout
Tarif relevé
dès 9,99 € HT/mois

Tiime réunit la facturation, la comptabilité et un compte pro selon la formule, avec une offre d'entrée destinée aux auto-entrepreneurs. Pratique pour n'avoir qu'un seul abonnement.

Points forts

  • Un seul outil pour la banque et la compta
  • Formule dédiée aux auto-entrepreneurs

Points faibles

  • Pas de formule gratuite
  • Compte pro sous conditions d'éligibilité

Ce que la loi demande à un auto-entrepreneur

Un logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur sert à tenir les registres obligatoires et à préparer les déclarations. En micro-entreprise, la loi demande peu : un livre des recettes, parfois un registre des achats, et la conservation des factures. Pas de bilan, pas de compte de résultat.

Obligation Pour qui Contenu
Livre des recettes Tous les auto-entrepreneurs Date, client, montant, mode de paiement, dans l’ordre chronologique
Registre des achats Vente de marchandises, hébergement Date, fournisseur, montant, mode de paiement
Conservation des factures et justificatifs Tous Plusieurs années (en général 10 ans pour les pièces comptables)
Compte bancaire dédié Au-delà de 10 000 € de chiffre d’affaires deux années de suite Voir notre comparatif des comptes pro

Quel logiciel choisir selon votre situation ?

Partez de ce que vous voulez automatiser, et de l’évolution prévue de votre entreprise.

Votre situation Ce qu’il vous faut Logiciels à regarder
Micro simple, peu d’opérations Livre des recettes gratuit Indy Essentiel, Abby gratuit
Beaucoup de factures, suivi des seuils Facturation + recettes + cotisations Abby
Passage au réel ou en société prévu Comptabilité complète possible Indy, Pennylane
Un seul outil pour la banque et la compta Compte pro inclus Tiime, Pennylane
Freelance au projet Tableau de bord, prévisions Freebe

Les tarifs comparés

Tarifs relevés le 09/11/2026 sur les sites des éditeurs.

Logiciel Formule gratuite Formule payante d’entrée Remarque
Indy Oui (Essentiel) 9 € HT/mois Paiement annuel (12 € HT sans engagement)
Abby Oui 9 € HT/mois Comptabilité avancée en Business (33 € HT)
Tiime Non 9,99 € HT/mois Paiement annuel, compte pro selon formule
Pennylane Non 7 € HT/mois Avec le compte pro Pennylane ; 14 € HT/mois sinon (relevé du 10/11/2026)
Freebe Non 12,50 €/mois 150 € TTC par an

Coût sur un an, formule d’entrée payante : 9 × 12 = 108 € HT pour Indy ou Abby, 119,88 € HT pour Tiime, 150 € TTC pour Freebe.

Les fonctions qui comptent

  • Synchronisation bancaire : les encaissements remplissent le livre des recettes tout seuls.
  • Rapprochement avec les factures : chaque paiement est relié à sa facture.
  • Préparation de la déclaration Urssaf : le chiffre d’affaires du mois ou du trimestre calculé ; notre guide des cotisations de l’auto-entrepreneur explique le calcul.
  • Alertes de seuils : TVA et plafond du régime micro.
  • Export pour un comptable : utile le jour où vous en prenez un.

Quand passer à une vraie comptabilité ?

Quand vous quittez le régime micro : passage au réel, dépassement des plafonds deux années de suite, ou création d’une société.

  • Au réel, les frais deviennent déductibles, mais il faut une comptabilité complète (bilan, compte de résultat).
  • En société, la comptabilité d’engagement est obligatoire, et souvent un expert-comptable.
  • Choisir dès maintenant un outil qui suit ce changement (Indy, Pennylane, Tiime) évite une migration plus tard.

Pour la facturation, qui alimente la comptabilité, voir notre comparatif des logiciels de facturation pour auto-entrepreneur.

Sources officielles

  • entreprendre.service-public.fr : obligations comptables du micro-entrepreneur.
  • autoentrepreneur.urssaf.fr : déclaration du chiffre d’affaires.

Tarifs relevés le 09/11/2026 sur les sites des éditeurs (Pennylane relevé le 10/11/2026). Ce comparatif ne remplace pas le conseil d’un expert-comptable.

Questions fréquentes

Un auto-entrepreneur doit-il tenir une comptabilité ?

Une comptabilité simplifiée : un livre des recettes chronologique (date, client, montant, mode de paiement), un registre des achats pour la vente de marchandises et l'hébergement, et la conservation des factures et justificatifs.

Quel logiciel de comptabilité gratuit pour auto-entrepreneur ?

Indy Essentiel et la formule gratuite d'Abby permettent de tenir le livre des recettes sans payer. Vérifiez ce que chaque formule gratuite inclut, notamment la synchronisation bancaire.

Faut-il un expert-comptable en micro-entreprise ?

Ce n'est pas obligatoire. Un logiciel suffit pour tenir le livre des recettes et déclarer à l'Urssaf. Un expert-comptable devient utile au passage au réel, en société, ou pour une question fiscale précise.

Excel suffit-il pour le livre des recettes ?

Oui, s'il est tenu chronologiquement avec toutes les mentions et conservé. Un logiciel évite les oublis et relie les recettes au compte bancaire et aux factures.

Le logiciel de comptabilité est-il déductible ?

Pour une entreprise au réel, oui. Pour un micro-entrepreneur, non : l'abattement forfaitaire couvre déjà les frais.

Alexandre Théron

Fondateur et rédacteur en chef

Notre choixIndy
Voir l’offre